★国家级科研机构
水文水资源与水利工程科学国家重点实验室
水资源高效利用与工程安全国家工程研究中心
★省部级科研机构
浅水湖泊综合治理与资源开发教育部重点实验室
海岸灾害及防护教育部重点实验室
岩土力学与堤坝工程教育部重点实验室
南方地区高效灌排与农业水土环境教育部重点实验室
水利水电工程安全教育部工程研究中心
疏浚技术教育部工程研究中心
可再生能源发电技术教育部工程研究中心
江苏省交通基础技术工程研究中心
江苏省岩土工程技术工程研究中心
江苏省循环经济工程中心
江苏省水灾害监控与决策支持系统工程中心
东部资源环境与持续发展研究中心
江苏省输配电装备技术重点实验室
江苏省大型工程地基基础稳定性与安全监控工程技术研究中心
江苏省建筑物裂缝控制工程技术研究中心
水利经济研究所
水利部水工金属结构安全检测中心
水利部水库移民经济研究中心
水利部人力资源研究院
水利政策法制研究与培训中心
江苏省水资源与可持续发展研究中心
江苏企业国际化发展研究基地—江苏省决策咨询基地
教育部城市环境与可持续发展联合研究中心
水利部水力发电工程重点实验室
水利部结构力学与水工结构工程重点实验室
水利部岩土工程重点实验室
水利部机电控制及自动化重点实验室
水利部河口海岸工程重点实验室
水利部节水园区
★国际合作科研机构
中德水资源研究所
中港水利建设3S技术应用联合实验室
中-荷环境岩土工程合作研究中心
中加瞬变流仿真与控制研究中心
中德海岸工程研究所
中美全球变化与水循环联合研究中心
中荷水研究中心
★市级科研机构
南京市土工合成材料工程研究中心
常州市数字化制造技术重点实验室
常州市输配电及节电技术重点实验室
常州市传感网与环境感知重点实验室
南通老葡京电子游戏网站海洋与近海工程研究院
★校内主要研究机构
新材料新能源研究开发院
高等教育研究所
水文预报研究所
工程水文及水文气象研究所
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